Στο αρχικό Black Flag, ανάμεσα στα ιστορικά κομμάτια ως Edward, οι παίκτες αναλάμβαναν τον ρόλο ενός νέου υπαλλήλου στην Abstergo Entertainment, μια βιντεοπαιχνιδική διεύθυνση της εταιρείας-βιτρίνας των Ναϊτών. Σε αυτά τα τμήματα, που παιζόταν από πρώτο πρόσωπο, οι παίκτες μάθαιναν περισσότερα για τον συνεχιζόμενο πόλεμο μεταξύ Ασσασινών και Ναϊτών, καθώς και για το πώς και οι δύο πλευρές προσπαθούσαν να χρησιμοποιήσουν την τεχνολογία Animus για να ανακαλύψουν μυστικά από το παρελθόν, ώστε να αποκτήσουν πλεονέκτημα στο παρόν. Βάσει των σχολίων των devs και της έλλειψης screenshots ή gameplay, φαίνεται πως τα περισσότερα από αυτά έχουν πλέον εξαφανιστεί. Αυτό θα έχει βαθιά επίδραση στις τελευταίες ώρες του παιχνιδιού, τις οποίες δεν θα χαλάσω εδώ, αλλά περιλαμβάνουν τους χαρακτήρες της σύγχρονης εποχής και πολλά τρελά πράγματα.
Ενώ κάποιοι παίκτες μισούσαν τη σύγχρονη αφήγηση και τα τμήματα, εγώ πάντα τα απολάμβανα γιατί έδιναν πικάντικη γεύση στον κόσμο του Assassin’s Creed. Πρόσθεταν αυτή την ευρύτερη μετα-αφήγηση στα γεγονότα κάθε παιχνιδιού, κι ακόμα κι αν η ιστορία μιας συγκεκριμένης περιόδου δεν ήταν ενδιαφέρουσα, μπορούσα να πάρω ψίχουλα για το τι συνέβαινε στον μεγαλύτερο, σύγχρονο αγώνα μεταξύ Ασσασινών και Ναϊτών. Οι πιο πρόσφατοι τίτλοι έχουν βασικά αφαιρέσει όλα αυτά, ενώ η Ubisoft ισχυρίζεται ότι θα συνεχιστούν με διαφορετική μορφή στο μέλλον.
Αλλά προς το παρόν φαίνεται πως έχουν μείνει πίσω, κι ενώ κάποιοι θα πανηγυρίσουν, εγώ εδώ λείπω τη Rebecca και τον Shaun και αναρωτιέμαι τι κάνουν τώρα…